صندوق ضمانت سرمایه‌گذاری بخش تعاون به عنوان یک سازمان دولتی دارای رسالت و اهداف ویژه‌ای جهت استفاده حداکثری از منابع و نزدیک شدن هر چه بیشتر به اهداف توسعه کشور و حمایت از بخش تعاون و تعاونی ها، نیازمند تبیین و تعیین اولویت های ارائه خدمت می باشد. این صندوق جهت پیشبرد اهداف بخش تعاون و همسوئی و هم‌راستائی آن با استراتژی‌ها و اهداف نظام، متقاضیانی را در اولویت خدمت‌رسانی قرار می دهد که بتوانند با کمترین منابع به حداکثر نتایج برسند. طرح‌های اولویت‌دار طرح‌هایی است که اهمیت آنها در اسناد بالادستی نظام ازجمله سیاست‌های ابلاغی مقام معظم رهبری، برنامه پنجم توسعه، سند چشم انداز بیست ساله و اهداف عالیه وزارت تعاون، کار و رفاه اجتماعی تهیه و تدوین گردیده است. با عنایت به موارد فوق اولویت‌های صندوق به شرح ذیل اعلام می گردد: طرح‌های تعاونی‌های دانش بنیان: شركت تعاوني است كه به منظور هم‌افزايي علم و ثروت، توسعه اقتصاد دانش محور، تحقق اهداف علمي و اقتصادي، شامل گسترش و كاربرد اختراع و نوآوري و تجاري‌سازي نتايج تحقيق و توسعه، شامل طراحي و توليد كالا و خدمات در حوزه فناوري‌هاي برتر و با ارزش افزوده فراوان به ويژه در توليد نرم افزارهاي مربوط تشكيل مي‌شود. ضمناً این گونه شرکت‌ها باید دارای تاییدیه‌های لازم از سوی بنیاد ملی نخبگان باشند. طرح‌های اشتغال‌زا: طرح‌هایی که دارای اشتغال‌زایی بالا نسبت به حجم سرمایه‌گذاری صورت گرفته می‌باشند (طرح‌هایی که سرانه اشتغال آنها کمتر از متوسط سرانه اشتغال کشور باشد). طرح‌های با محوریت کالاها و خدمات صادراتی: شرکت‌های تعاونی که دارای تولید محصولات و ارائه خدمات صادراتی، با ارزش افزوده و خالص ارز آوری مثبت می باشند. طرح‌های افزایش تولیدات داخلی نهاده‌ها و کالاهای اساسی: شرکت‌های تعاونی که دارای تولید محصولات و خدمات راهبردی و تامین کالاهای وارداتی با هدف کاهش وابستگی به کشورهای محدود و خاص هستند. طرح‌های مناطق محروم و کمتر توسعه یافته: طرح‌های شرکت‌های تعاونی در مناطق محروم و کمتر توسعه یافته که این مناطق، طبق تصویب نامه هیئت‌ وزیران در جلسه مورخ 1388/2/20 بنا به پیشنهاد شماره 100/17257 مورخ 1387/2/29 معاونت برنامه‌ریزی و نظارت راهبردی رییس‌جمهور و به استناد اصل یکصد و سی و هشتم قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران به تصویب رسیده است. طرح‌های حمایتی از صنایع مادر و طرح‌های ملی: طرح‌های شرکت‌های تعاونی که در صنایع مادر و استراتژیک، مانند صنایع فولاد، ذوب آهن، طرح‌های ملی کشاورزی، پتروشیمی و نیروگاهی فعالیت دارند. طرح‌های اشتغال زا برای فارغ التحصیلان دانشگاهی بیکار و استعدادهای برتر: طرح‌های شرکت‌های تعاونی که دارای اشتغال‌زایی بیش از پنج نفر برای فارغ التحصیلان دانشگاهی بیکار را به همراه دارد.